深圳市眼科医院迟玮教授和牛龙见研究员团队的最新研究成果于11月18日发表在国际顶尖期刊《分子细胞》(Molecular Cell)上。该刊影响因子达16.6,属中国科学院一区期刊,深圳市眼科医院为论文第一完成单位及第一作者、通讯作者单位。
团队自主研发的 Hi-Coatis 高通量技术,破解了传统研究的局限。以往技术或仅能捕捉基因 “表达信号”,或仅能观察基因空间结构,而这一新技术如同 “基因对话监控系统”,可在单次实验中同步捕获活跃转录区域及其三维互作信号,构建更全面的基因调控图谱。
该技术具备多重创新特性:采用轻度交联技术保留基因真实转录状态,通过 RNA 引导的 DNA 链标记精准锁定活跃基因区域,可按需保留链特异性信息,且无需抗体或探针即可完成信号捕获,最终经高通量测序绘制出高分辨率三维染色质图谱。
研究中最显著的发现,是揭示了曾被视为 “基因组噪音” 的重复序列与拷贝数变异区域(CNV)的重要作用。团队通过 Hi-Coatis 技术发现,这类区域不仅高度活跃,还与高表达基因密切关联,功能验证显示超 77% 的相关片段具有明确调控活性,颠覆了对这类基因组区域的传统认知。
迟玮教授介绍,Hi-Coatis 技术为解析基因表达与三维染色质结构的关系提供了关键工具,对理解发育分化机制及眼科疾病等多种病症的发病原理具有重要价值,为构建高精度基因调控网络奠定基础。
采写/剪辑:南方+记者 曾南希
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