近日,“9月新增本土新冠死亡病例45例”冲上热搜,据中国疾控中心最新通报,9月1日至30日,我国31个省(自治区、直辖市)及新疆生产建设兵团报告新增重症病例398例、死亡病例45例,其中新冠病毒感染导致呼吸功能衰竭死亡病例1例、基础疾病合并新冠病毒感染死亡病例44例。网友评论“它在,一直都在”,最近二阳、三阳的人也不少呢……
提到新冠,大多数人会比较关注其和呼吸道的关系,其实,肠道菌群水平也会影响病毒感染后症状表现及后遗症。
近日,中山大学副校长、我院胃肠病学研究所所长兰平教授和胃肠病学研究所副所长左涛研究员团队于国际病毒学知名杂志Journal of Medical Virology (IF=12.7, Q1) 发表题为“Baseline gut microbiome features prior to SARS-CoV-2 infection are associated with host symptoms in and post COVID-19”的研究文章,文章具体揭示了新冠前基线肠道菌群水平与病毒感染后人体症状表现及后遗症的关联性,有助于进一步探究利用肠道菌群抗病毒感染的可行性。

每个人的肠道内寄居了超过40万亿的细菌,由它们组成的肠道菌群,对人们的免疫力、消化和代谢等方面产生重要影响,与我们的生活和健康息息相关,因此肠道菌群也被称为“第二大脑”。但不同人群不同个体之间,其基线肠道菌群存在巨大的差异,故而对人体对疾病的易感性影响也相差甚远。
既往研究报道,肠道菌群与个体感染新型冠状病毒(SARS-CoV-2,下述简称“新冠”)后的疾病严重程度显著相关。但由于缺乏患者感染新冠前的基线肠道菌群信息,现有的研究不能进一步探讨菌群是如何先验性地调控相关症状的,也不能阐明有哪些菌群在相关症状的调控中扮演了重要的角色。基于这一科学问题,我院兰平、左涛团队进行了一项探索性的、关于微生物组-COVID-19的纵向研究(新冠感染前后随访)。
首先,研究团队提出假设:在稳态下,基线肠道菌群巨大的异质性可能会使得个体的免疫力和对病毒的易感性有较大的差异,并在遇到病毒感染(例如 SARS-CoV-2感染)时介导机体产生不同的免疫反应和症状。为了验证这一假设,团队招募了国内不同区域的年轻健康志愿者,组成了一个高质量高度均质化的队列。项目在志愿者感染新冠前,采集了所有志愿者的粪便样本,并提取其中的肠道菌群作为基线数据,并在志愿者自然感染新冠后对其进行随访,以评估他们感染新冠后的相关症状及后遗症表现。
研究结果表明,个体的基线肠道微菌群特征与其感染新冠后的不同症状反应,特别是胃肠道受累和延绵存续的后遗症,呈现出以个体和人群依赖性的、错综复杂的相关性。更重要的是,该研究首次提出稳态下的基线肠道菌群可能会导致个体抵御呼吸道病毒感染的能力存在显著差异。

人体基线肠道菌群与感染新冠后症状和新冠后遗症的相关性
研究发现,新冠感染后症状不严重的个体中,肠道菌 Ruminococcus callidus 的含量相对丰富,而新冠感染后症状相对严重的个体中,肠道菌Bacilli bacterium, Veillonella tobetsuensis, and Eubacterium sp NSJ 61的含量相对丰富。此外,4中Streptococcus属的肠菌与新冠后症状的强度和持续时长成正相关(尤其Streptococcus intermedius)。研究还发现,肠道中肠菌Fecalibacterium prausnitzii 的存在是新冠感染后消化道症状的保护性因素;当个体不存在Fecalibacterium prausnitzii时,容易产生新冠感染后消化道反应。

肠道菌群在新冠病毒感染易感性中的重要作用
我院在读博士生梁冠湛、黄子誉和曹智睿为研究论文的共同第一作者,兰平教授和左涛研究员为论文的共同通讯作者。
原文链接:
(点击阅读原文或复制以下地址至浏览器)
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/jmv.29083
专家介绍

兰平 教授
二级教授、一级主任医师、博士生导师,中山大学附属第六医院结直肠外科学科带头人。国务院特殊津贴获得者、国之名医“卓越建树”奖获得者、卫生部有突出贡献中青年专家、“南粤百杰”人才。
科研成果:取得40余项资金资助,在JCO、Cell Discovery、Mol Cancer、Microbiome、Biomaterials、Signal Transduct Target Ther.等杂志共发表论著300余篇,高水平论文收录180余篇。
医疗专长:从事结直肠外科临床和教学工作30余年,专注于结直肠癌及炎症性肠病的外科治疗,尤其是微创外科手术,每年主刀手术500余台,尤其擅长低位直肠癌的保肛手术、局部晚期或复发性结直肠癌、克罗恩病并发症以及溃疡性结肠炎的手术治疗。
出诊时间:周一上午

左涛 研究员
中山大学胃肠病学研究所副所长,中山大学人体微生态与慢病教育部重点实验室副主任,中山大学实验动物中心副主任,中山大学“百人计划”中青年杰出人才。
获得美国消化道疾病学会(AGA)“青年研究奖”、香港中文大学研究计划fellowship、欧洲克罗恩病与结肠炎委员会(ECCO)青年委员、国际微生物病毒协会(ISVM)会员、美国微生物学会(ASM)会员、中国人体健康科技促进会肠道微生态与菌群移植专业委员会常务委员、广东省精准医学应用学会微生态医学分会委员、广东省精准医学应用学会长青智库工作委员会委员。
以通讯或第一作者发IF>10的文章24篇,包括 Cell Host & Microbe (2) 、Lancet Gastroenterology & Hepatology (1)、Lancet Microbe (1)、Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology (2)、Nature Reviews Microbiology (1)、Nature Reviews Bioengineering (1)、Gut (5)、Gastroenterology (4)、Microbiome (2)、Nature Communications (2)、eBioMedicine (1) 、Gut Microbes (1)、Journal of Medical Virology (1)等,以参与作者在Nature Genetics等杂志发表文章10余篇。
责任编辑:张婷婷
初审:戴希安
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内容来源:中山六院
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